MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011982	ATC	3	9	35344	35352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080145
502	NC_011982	GGC	2	6	35454	35459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080146
503	NC_011982	AGA	2	6	35486	35491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080146
504	NC_011982	CG	3	6	35550	35555	0 %	0 %	50 %	50 %	222080146
505	NC_011982	TCTT	2	8	35558	35565	0 %	75 %	0 %	25 %	222080146
506	NC_011982	CG	3	6	35567	35572	0 %	0 %	50 %	50 %	222080146
507	NC_011982	GCT	2	6	35615	35620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080147
508	NC_011982	GCA	2	6	35622	35627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080147
509	NC_011982	TCG	2	6	35641	35646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080147
510	NC_011982	CTG	2	6	35659	35664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080147
511	NC_011982	GCC	2	6	35700	35705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080147
512	NC_011982	CTCGAT	2	12	35762	35773	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222080147
513	NC_011982	GGCC	2	8	35782	35789	0 %	0 %	50 %	50 %	222080147
514	NC_011982	TTC	2	6	35864	35869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080147
515	NC_011982	TTC	2	6	35889	35894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080147
516	NC_011982	TCG	2	6	40889	40894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080148
517	NC_011982	T	7	7	40917	40923	0 %	100 %	0 %	0 %	222080148
518	NC_011982	CCT	2	6	40959	40964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080148
519	NC_011982	CTT	2	6	41041	41046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080148
520	NC_011982	CGA	2	6	41173	41178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080148
521	NC_011982	GCG	2	6	41197	41202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080148
522	NC_011982	TCT	2	6	41217	41222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080148
523	NC_011982	GTC	2	6	41225	41230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080148
524	NC_011982	GCG	2	6	44016	44021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080149
525	NC_011982	ACC	2	6	44042	44047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080149
526	NC_011982	TG	3	6	44229	44234	0 %	50 %	50 %	0 %	222080149
527	NC_011982	ACA	2	6	44251	44256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080149
528	NC_011982	CCA	2	6	44274	44279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080149
529	NC_011982	CGA	2	6	44287	44292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080149
530	NC_011982	CGG	2	6	44481	44486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080149
531	NC_011982	TGCGA	2	10	44516	44525	20 %	20 %	40 %	20 %	222080149
532	NC_011982	AG	3	6	44701	44706	50 %	0 %	50 %	0 %	222080149
533	NC_011982	CGC	2	6	44730	44735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080149
534	NC_011982	AAC	2	6	44805	44810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080149
535	NC_011982	CCCG	2	8	44843	44850	0 %	0 %	25 %	75 %	222080149
536	NC_011982	GGCAT	2	10	44877	44886	20 %	20 %	40 %	20 %	222080149
537	NC_011982	GAT	2	6	44891	44896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080149
538	NC_011982	ATG	2	6	44911	44916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080149
539	NC_011982	CGCT	2	8	44933	44940	0 %	25 %	25 %	50 %	222080149
540	NC_011982	ACG	2	6	45011	45016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080150
541	NC_011982	GTG	2	6	45030	45035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080150
542	NC_011982	GAAA	2	8	45153	45160	75 %	0 %	25 %	0 %	222080150
543	NC_011982	CTG	2	6	45247	45252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080150
544	NC_011982	GCC	2	6	45306	45311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080150
545	NC_011982	CT	3	6	45366	45371	0 %	50 %	0 %	50 %	222080150
546	NC_011982	CTT	2	6	45494	45499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080151
547	NC_011982	GATCTT	2	12	45642	45653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222080151
548	NC_011982	GC	3	6	45667	45672	0 %	0 %	50 %	50 %	222080151
549	NC_011982	ATC	2	6	45705	45710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080151
550	NC_011982	GCG	2	6	45741	45746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080151
551	NC_011982	TCA	2	6	45769	45774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080151
552	NC_011982	CGATG	2	10	45855	45864	20 %	20 %	40 %	20 %	222080151
553	NC_011982	GCA	2	6	45910	45915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080151
554	NC_011982	TTC	2	6	45987	45992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080151
555	NC_011982	CGG	2	6	46010	46015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080151
556	NC_011982	TCT	2	6	46073	46078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080151
557	NC_011982	AAT	2	6	46092	46097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080151
558	NC_011982	TG	3	6	46208	46213	0 %	50 %	50 %	0 %	222080151
559	NC_011982	CGC	2	6	46224	46229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080151
560	NC_011982	CAG	2	6	46263	46268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080151
561	NC_011982	AGG	2	6	46486	46491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080151
562	NC_011982	AAGGGC	2	12	46509	46520	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222080151
563	NC_011982	GT	3	6	46568	46573	0 %	50 %	50 %	0 %	222080151
564	NC_011982	GTC	2	6	46659	46664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080151
565	NC_011982	CGT	2	6	46759	46764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080151
566	NC_011982	AGA	2	6	46831	46836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080151
567	NC_011982	TGC	2	6	46844	46849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080151
568	NC_011982	TCA	2	6	46910	46915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080151
569	NC_011982	GTC	2	6	46929	46934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080151
570	NC_011982	GCA	2	6	46943	46948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080151
571	NC_011982	GCC	2	6	46949	46954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080151
572	NC_011982	TCC	2	6	46960	46965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080151
573	NC_011982	GCG	2	6	46971	46976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080151
574	NC_011982	GGCA	2	8	47895	47902	25 %	0 %	50 %	25 %	222080152
575	NC_011982	TAC	2	6	47924	47929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080152
576	NC_011982	GC	3	6	47941	47946	0 %	0 %	50 %	50 %	222080152
577	NC_011982	T	6	6	48063	48068	0 %	100 %	0 %	0 %	222080152
578	NC_011982	TTG	2	6	48113	48118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080152
579	NC_011982	GAC	2	6	48189	48194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080152
580	NC_011982	GGA	2	6	48265	48270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080152
581	NC_011982	GAT	2	6	48340	48345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080152
582	NC_011982	TCG	2	6	48367	48372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080152
583	NC_011982	CTG	2	6	48479	48484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080152
584	NC_011982	GCC	2	6	48506	48511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080152
585	NC_011982	TTC	2	6	48518	48523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080152
586	NC_011982	TTG	2	6	48548	48553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080152
587	NC_011982	CCA	2	6	48654	48659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080152
588	NC_011982	CAA	2	6	48668	48673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080152
589	NC_011982	GAA	3	9	48700	48708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080152
590	NC_011982	CGG	2	6	48721	48726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080152
591	NC_011982	GCG	2	6	48748	48753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080152
592	NC_011982	CGG	2	6	48808	48813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080152
593	NC_011982	GC	3	6	48845	48850	0 %	0 %	50 %	50 %	222080152
594	NC_011982	TGA	2	6	49718	49723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080153
595	NC_011982	TCG	2	6	49729	49734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080153
596	NC_011982	GA	3	6	49832	49837	50 %	0 %	50 %	0 %	222080153
597	NC_011982	CAGC	2	8	49853	49860	25 %	0 %	25 %	50 %	222080153
598	NC_011982	GGT	2	6	50059	50064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080154
599	NC_011982	ATC	2	6	50070	50075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080154
600	NC_011982	GCC	2	6	50170	50175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080154
601	NC_011982	ATA	2	6	50192	50197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080154
602	NC_011982	GCC	2	6	50247	50252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080154
603	NC_011982	AAT	2	6	50261	50266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080154
604	NC_011982	GC	3	6	50284	50289	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
605	NC_011982	AT	3	6	50295	50300	50 %	50 %	0 %	0 %	222080154
606	NC_011982	CGA	2	6	50315	50320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080154
607	NC_011982	CAA	2	6	50331	50336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080154
608	NC_011982	TGG	2	6	50385	50390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080154
609	NC_011982	AGT	2	6	50419	50424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080154
610	NC_011982	AGG	2	6	50467	50472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080154
611	NC_011982	CGGC	2	8	50501	50508	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
612	NC_011982	GTA	2	6	50528	50533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080154
613	NC_011982	GCCATT	2	12	50534	50545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222080154
614	NC_011982	TGA	2	6	50574	50579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080154
615	NC_011982	GTC	2	6	50588	50593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080154
616	NC_011982	GCA	2	6	50616	50621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080154
617	NC_011982	AGC	2	6	50634	50639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080154
618	NC_011982	AGG	2	6	50841	50846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080154
619	NC_011982	CGA	2	6	50854	50859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080154
620	NC_011982	CGC	2	6	50863	50868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080154
621	NC_011982	TGA	2	6	50914	50919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080154
622	NC_011982	GC	3	6	51080	51085	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
623	NC_011982	TCG	2	6	51157	51162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080154
624	NC_011982	TTC	2	6	51185	51190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080154
625	NC_011982	GGC	2	6	51210	51215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080154
626	NC_011982	ATT	2	6	51394	51399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080155
627	NC_011982	CTGA	2	8	51432	51439	25 %	25 %	25 %	25 %	222080155
628	NC_011982	GCC	2	6	51473	51478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080155
629	NC_011982	GCT	2	6	51526	51531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080155
630	NC_011982	GCT	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080155
631	NC_011982	GC	4	8	51567	51574	0 %	0 %	50 %	50 %	222080155
632	NC_011982	CTG	2	6	51581	51586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080155
633	NC_011982	TCA	2	6	51651	51656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080155
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635	NC_011982	GTC	2	6	51802	51807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080156
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640	NC_011982	G	6	6	52344	52349	0 %	0 %	100 %	0 %	222080156
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649	NC_011982	TCGGCA	2	12	53084	53095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222080158
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653	NC_011982	CGGCG	2	10	53345	53354	0 %	0 %	60 %	40 %	222080158
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657	NC_011982	CGC	2	6	53434	53439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080158
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661	NC_011982	CGC	2	6	53630	53635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080158
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749	NC_011982	GCC	2	6	58516	58521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080162
750	NC_011982	TCG	2	6	58526	58531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080162
751	NC_011982	GGAT	2	8	58547	58554	25 %	25 %	50 %	0 %	222080162
752	NC_011982	CATC	2	8	58566	58573	25 %	25 %	0 %	50 %	222080162
753	NC_011982	TGC	2	6	58626	58631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080162
754	NC_011982	GCC	2	6	58655	58660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080162
755	NC_011982	GTC	2	6	58759	58764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080162
756	NC_011982	AGA	2	6	58793	58798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080162
757	NC_011982	CCGATC	2	12	58829	58840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222080162
758	NC_011982	ACCG	2	8	58843	58850	25 %	0 %	25 %	50 %	222080162
759	NC_011982	CAA	2	6	58878	58883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080162
760	NC_011982	GTC	2	6	59098	59103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080162
761	NC_011982	GCC	2	6	59125	59130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080162
762	NC_011982	TGG	2	6	59168	59173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080162
763	NC_011982	ATGAA	2	10	59177	59186	60 %	20 %	20 %	0 %	222080162
764	NC_011982	CG	3	6	59219	59224	0 %	0 %	50 %	50 %	222080162
765	NC_011982	ATC	3	9	59248	59256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080162
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770	NC_011982	TCG	3	9	59483	59491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080162
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780	NC_011982	ATA	2	6	60134	60139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080162
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787	NC_011982	TCA	2	6	60496	60501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080162
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794	NC_011982	GGCA	2	8	60716	60723	25 %	0 %	50 %	25 %	222080162
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871	NC_011982	TCC	2	6	64596	64601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080164
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877	NC_011982	GCC	2	6	64766	64771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080164
878	NC_011982	CGC	3	9	64841	64849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080164
879	NC_011982	GCCCGC	2	12	64850	64861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080164
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